“e-Pulse”, yang dihasilkan oleh pikiran dan emosi manusia, digunakan sebagai sumber energi untuk perangkat pendukung AI “Sapotama”. Dari bayang-bayang perkembangan luar biasa ini, monster-monster menakutkan muncul. Digimon adalah makhluk hidup yang berevolusi dengan mengonsumsi e-Pulse.
Tomoro Tenma mengalami pengalaman luar biasa setelah bertemu Gekkomon yang tiba-tiba muncul dari Sapotama miliknya. Saat tinggal bersama Kyo Sawashiro dan anggota tim pemburu hadiah “Fajar Emas” lainnya, Tomoro memperbarui tekadnya. Masa depan baru apa yang akan ditempa oleh manusia dan Digimon?